Candi Gedong III ini berbeda jauh dengan candi-candinya sebelumnya, karena terdapat tiga buah candi, yakni: satu buah bangunan candi yang agak besar (candi induk) dan juga terdapat dua buah bangunan candi perwara (candi Perwara I dan II). Jarak antara Candi Gedong II dengan Candi Gedong III ini adalah sekitar
119.5 m. Bentuk induk Candi Gedong III ini adalah persegi dengan panjang 5.86m dan lebar 5.54m. Pada relung-relungnya ini ada arca di sekitarnya, arca tersebut antara lain:
– Arca Durga Mahisasuramardhini (di bagian sisi utara)
– Arca Ganesha (di bagian timur)
– Arca Agastya (di bagian sisi selatan)
Ada pula di bagian pintu masuknya ini terdapat aksen bunga teratai keluar dari jambangan dan disangga oleh tiga laki-laki yang menghiasinya. Pada bagian atas relungnya ini dihias kepala kala berkumis dengan sepasang nakara. Terdapat pintu masuk ke dalam candi yang dibuat menonjol dengan atap pintu yang berbentuk busur. Sedangkan atap candinya ini bentuknya bertingkat-tingkat tanpa ada hiasan pada bagian badan atapnya, sedangkan di bagian bidang batas tiap-tiap tingkatan atapnya dihiasi dua antefiks sepasang arca penjaga, yaitu arca Mahakala yang membawa geda, dan juga arca Nandiswara yang memegang sebuah kendi. Ruang utama di bangunan sisi-sisinya 1.66m, saat ini ruang tersebut dalam keadaan kosong.